ginekolog nfz białystok opinie

Spośród 2,471 genów regulowanych różnicowo w skórze Grhl3 KO od E14.5 do E18,5, 796 może być połączony z pobliskim zarodkowym szczytem ChIP GRHL3 (. 50 kb z TSS, nakładanie znaczące, P <1,58 x 10 10, Figura 7A i dodatkowa Figura 9B). Wśród nich było zróżnicowanie naskórka. i związane z barierą naskórkową geny Evpl, Lor, Tgm1, Elovl1, Elovl7, Smpd1 i Cldn6 (dodatkowa figura 12A); ontologia genu wykazała wzbogacenie w metabolizmie lipidów, sygnalizację GTPazy, różnicowanie nabłonka i homeostazę komórek jonowych (Figura 7B i Suplementowa Figura 9, C = E). Tak więc, podczas rozwoju naskórka GRHL3 wydaje się bezpośrednio regulować ekspresję wielu kluczowych genów wymaganych do prawidłowego różnicowania naskórka i tworzenia bariery. Ryc. 7 Wiązanie genomowe GRHL3, regulacja docelowa i ontologia genu. (A) nakładanie się pików ChIP E16.5 GRHL3 i DEG (delecja Grhl3 w skórze embrionalnej). (B) Ontologia ontologiczna celów embrionalnych GRHL3 (zarodkowe DEG z proksymalnym zarodkowym szczytem GRHL3, w zakresie od +10 do ~ 5 kb ich TSS). (C) Nakładanie się pików ChIP GRHL3 ChIP i DEG (zrogowaciały naskórek pozbawiony wosku Grhl3 cKO). (D) Ontologia ontologiczna celów usuwania wosków GRHL3 (usuwanie wosku DEG z proksymalnym usuwaniem wosków pików GRHL3). (E) Nakładanie się pików ChIP IMEG GRHL3 i DEG (epiderma Grhl3 cKO IMQ). (F i G) Ontologia genu docelowych GRQL3 IMQ (IMQ DEGs z proksymalnymi pikami GRHL3 IMQ) w dniu 4 leczenia (F) i dnia 4 odzyskiwania (G). Podczas odzyskiwania woskowego odpędzania dorosłych, w skórze Grhl3 cKO było 1.243 różnych genów regulowanych różnicowo (Figura 7C, Suplementowa Figura 10A i Tabela Uzupełniająca 5); geny te wykazały wzbogacenie w metabolizmie lipidów, różnicowaniu nabłonka oraz strukturze i organizacji ECM (Suplemental Fig. 9B). Spośród tych genów, 326 może być związane z pobliskim szczytem ChIP do usuwania wosku (zachodzenie znaczące, P <0,0381,> 50 kb); bezpośrednie cele wykazały wzbogacenie w morfogenezę, różnicowanie i rozwój nabłonka (Figura 7D). Wiele celów genowych w skórze oblanej woskiem uczestniczyło w procesach różnicowania naskórka i powstawania barier, w tym członków rodziny Sprr, genów przetwarzania lipidów (Elovl3, Elovl4 i Alox8), genów powiązanych z śmiercią komórek (Bnip3, Scrib i Trp53bp2) i geny adhezji komórek (Ctnnal1, Pvrl4, Cyr61, Itga3, Lama1 i Lamc1) (dodatkowa figura 12B). Dane te pokazały, że GRHL3 także celuje i reguluje geny związane z barierą naskórkową po fizycznym uszkodzeniu bariery, chociaż w dużym stopniu specyficzne cele były inne niż te w rozwoju zarodkowym (Suplementowa Figura 12E). GRHL3 reguluje geny biorące udział w tłumieniu stanu zapalnego podczas uszkodzenia naskórka za pośrednictwem układu odpornościowego. Aby zrozumieć rolę Grhl3 w urazie naskórkowym za pośrednictwem układu immunologicznego, porównaliśmy ekspresję genów w naskórku WT i Grhl3 cKO w 4 dniu leczenia 5% IMQ, aw 4 dniu wyzdrowienia z leczenia 5% IMQ, identyfikując 769 i 2053 geny regulowane różnicowo , odpowiednio (Figura 7E, dodatkowa Figura 11, A i B, i Tabele Uzupełniające 6 i 7). Wzbogacona ontologia genu DEG podczas leczenia IMQ obejmowała metabolizm retinoidów, rozwój naczyń krwionośnych, lokalizację lipidów i rozwój nabłonka, podczas gdy różne kategorie stały się bardziej widoczne podczas powrotu do zdrowia po leczeniu IMQ, w tym odpowiedzi immunologicznej, rozwoju naskórka i różnicowania komórek naskórka (Supplemental Figure 11). , C i D). Najbardziej uderzające, podczas powrotu do zdrowia po leczeniu IMQ, wystąpiła silna nadekspresja licznych odpowiedzi na uszkodzenie naskórka. oraz zmiany związane z uszkodzeniem łuszczycowym, w tym alarminą S100a8, defensyną Def3b i Tslp, znanym ważnym genem immunomodulującym w chorobie skóry; na geny te nie wpłynęła delecja Grhl3 podczas embriogenezy. Pobliskie wiązanie GRHL3 w danych IMQ ChIP-Seq (~ 50 kb) stwierdzono w 212 (nakładanie NS, P. 0,897) i 543 (zachodzenie znaczące, P. 0,0375) różnie regulowanych genów w skórze Grhl3 cKO w dniu traktowania IMQ. 4 i odpowiednio 4 dzień przywrócenia (rysunek 7E)
[hasła pokrewne: numer statystyczny choroby, olx puck, active food supplements polska ]